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miRNA荧光定量PCR试剂盒

Hairpin-it miRNAs RT-PCR Quantitation Kit的特点: 高度特异,特异性的Stem-loop RT primer与miR-specific Molecular Beacon probe双重保证,确保反应不受其前体及其他因素干扰;序列高度同源的miRNAs也可精确区分;

产品描述

目前,最常用的检测和定量miRNA的方法是northern杂交, 芯片(microarrays)以及核糖核酸酶保护分析(ribonuclease protection assays),这些传统方法都需要标记探针并与纯化的RNA进行杂交。由于成熟的miRNAs及其前体共享一段相同的靶序列,而目前基于杂交的各种技术又无法通过分子大小将它们区分,因此很难专一性的识别成熟miRNAs,结果导致很高的前体背景信号。 

此外,基于杂交的各种技术需要标记步骤或放射性同位素,所得数据的动态分布范围又很有限,使得miRNAs的检测非常困难、费时且昂贵。

1 Hairpin-itTM miRNAs RT-PCR  Quatitation Assay 包括两步

1) Stem-loop RT 

2) Real-time PCR

Stem-loop RT primer 与miRNA 分子的3’端结合,然后用逆转录酶将RNA逆转录成cDNA;
将得到RT产物与miRNA特异引物以及荧光标记的Molecular Beacon probes一起进行优化的real-time PCR反应。

2 Hairpin-itTM miRNAs RT-PCR Quantitation Kit 的特点

1) 高度特异,特异性的Stem-loop RT primer与miR-specific Molecular Beacon probe双重保证,确保反应不受其前体及其他因素干扰;序列高度同源的miRNAs也可精确区分;

2) 超宽的定量线性范围和高度检测灵敏度,从几个拷贝一直到几万个拷贝,定量线性范围跨越7个数量级;

3) 样品消耗量少,仅需1-10ng total RNA;

4) 适用的样品范围广,total RNA、细胞裂解物以及纯化的RNA都可以用于qRT-PCR 的模板,即使基因组DNA的污染也不会干扰miRNA的定量;

5) 金牌质量的miRNA标准合成物,即可精确用来作标准曲线绝对定量之用,又可用来作相对定量的阳性对照

6) 操作快速简单,可实现RT与PCR反应一步完成;

7) 重复性好,经过吉玛公司经验丰富的技术人员严格的质量检验。


3 Hairpin-itTM miRNAs RT-PCR Quantitation Kit 的产品订购信息

Hairpin-itTM  miRNAs RT-PCR Quantitation Kit
目录号 规格 价格
E01006 50 rxns ¥600
E01007 100 rxns ¥1,100
E01008 200rxns ¥2,000
E01009 300rxns ¥2,500
E01005 500 rxns ¥3,600

4 Hairpin-itTM miRNAs RT-PCR Quantitation Kit 的成分组成

ROX Reference Dye 是用以校正孔与孔之间产生的荧光信号误差,需要使用低浓度 ROX Reference Dye 校正的仪器有Applied Biosystems 7000/7300/7500/7500 Fast/7900 Real-Time PCR System,配套ROX 终浓度1×(0.4 µl);需要使用高浓度ROX Reference Dye 校正的 仪器有Applied Biosys-tems Step One Plus Real-Time PCR System 和QuantStudio系列,配套ROX 终浓度为5×(2 µl)。其他品牌仪器不需要ROX校准,ROX Reference Dye需要避光保存。


5 Hairpin-itTM  miRNAs RT-PCR Quantitation Kit 的适用机型

适用的荧光定量PCR仪器ABI PRISM 7000/7300/7500/7900 MJ-opticonOpticon2、Chromo4 及QuantStudio系列、MX3000p/4000 Bio-Rad IQ系列、Light Cycler、Rotogene3000、FTC-2000。


功能介绍与实验实例

Hairpin-itTM miRNAs RT-PCR Quantitation Kit提供的是利用实时荧光定量PCR对总 RNA中的miRNA检测与定量的一种方法,其不但灵敏而且极具特异性。miRNA 是由动物、植物和病毒基因组所编码的一种短小,单链,约有19-23个核苷 酸组成的RNA,成熟的miRNA参与组成“RNA诱导的沉默复合体”,并且指导该 复合体进行转录、转录后翻译的抑制或是特异性的内切靶mRNA。与一般的 miRNA检测方法不同,该Hairpin-itTM miRNAs RT-PCR Quantitation Kit具有更快速,更灵敏的特点。
 
   该试剂盒内有miRNA特异的逆转录引物,以及PCR正反向引物套装,并且 还带有荧光染料,茎-环结构样的miRNA特异逆转录引物以及高度特异的正反向引物使得逆转录和PCR反应避免了miRNA前体的干扰,而反应的模板可以是 总RNA或者细胞裂解物。


   为了校准实验样品之间由于总RNA量不一致所带来的误差,可以分别使 用吉玛的U6 snRNA 定量PCR校准试剂盒 (Cat # QPM-050)以及5S rRNA定量PCR校准试剂盒(Cat # QPM-060)。
 
 
 
  该体系提供了一种最低能检测到10个拷贝目标miRNA的高灵敏度的检测 方法,并且具有一个宽广的动态变化范围,能够实现从1μg总RNA中精确定 量检测高拷贝数的miRNA。
   
  高度特异性 茎环结构的逆转录引物以及miRNA高特异的引物套装保证了 该方法的高度特异性,即使是高度同源的miRNA都能被准确区分。
                        
  荧光定量PCR比传统的miRNAs定量检测方法(如Northern blot和micro-array)具有更宽广的动态变化范围(至少7 次方的数量)和更高的灵敏度,保证了该方法能够准确定量0.1pg总RNA 中,最低量至7个拷贝的目标miRNA。更总RNA、细胞裂解物或是已纯化的miRNA分离物都可用于试剂盒反应所需的模板,甚至有基因组DNA的污染也不会干扰miRNA定量。
   
  mmiRNA标准品能够用来制作标准曲线,当您想知道一个细胞中miRNA 的绝对数量时。如果您想得到miRNA和U6snRNA或者5S rRNA之间相对表达量之比,该标准品可起阳性对照的作用。
 


Hairpin-itTM miRNA定量分析包括两个步骤:茎环结构逆转录引物的逆转录反应和实时荧光定量PCR。茎环结构的逆转录引物能与miRNA的3’ 端的部分结合,在逆转录酶的作用下进行逆转录反应。然后特异的正反向引物和荧光染料共同参与的定量PCR反应体系,对上述逆转录产物进行 定量检测。


1 用户需要提供的材料  

1) RNA 酶抑制剂(RNase inhibitor)

RNA酶抑制剂是从人胎盘中提取的一种广谱的核糖核酸酶抑制剂,分子量
约50KDa,在cDNA合成过程中可保护RNA不被RNA酶降解,提高cDNA质
量。


2) 良好光学PCR板或PCR管

为了消除在荧光检测的步骤中由于 PCR 管或是 PCR96 孔板所带来的误
差,我们推荐您使用与ABI PRISM 7000/7300/7500/7900, MX3000p/4000p 等
仪器配套的PCR管及96孔板。


2 miRNA检测试剂盒

实验数据:吉玛公司的miRNA检测试剂盒具有良好的线性动态范围和灵敏度:









使用方法

Hairpin-itTMmiRNA 实时定量分析包括两步:茎环结构的逆转录反应和定量 PCR 检测。茎环结构的逆转录引物能与 miRNA 分子 的 3’端结合,并在逆转录酶的作用下进行反应,然后在高度特异的 正反向引物和荧光染料共同参与的定量 PCR 反应体系中,对上述逆转录产物定量检测。           
为了获得目标miRNA相对管家基因(如U6  snRNA 或者 5S rRNA)的相对表达量,U6 snRNA或者 5S rRNA定量PCR校准试剂 盒是非常必要的,请参照该说明书第一页的“相关产品”。如果您 想获取更多信息,请登陆我们的网站:http://www.genepharma.com。
 
miRNA 标准品的操作

吉玛提供的 miRNA 标准品是 1pmol 干粉的贮存形式,操作该标准品的时候请参照以下的技术指导:
稀释:把装有 RNA 标准品的管子于 10000 转/分钟离心一分钟。小心打开管盖,加入 1ml RNA dilution buffer(由试剂 盒提供)将此 RNA 标准品干粉稀释至 1nM,另拿一个 DEPC 处理过并灭菌过的 EP 管将 1nM 的贮存溶液稀释至 0.1nM 作 为工作浓度。然后再用同样处理的管子,把 0.1nM  的标准品 稀释液按照实验需要稀释成一系列的数量级(5~7 个)来制作标准曲线。
贮藏:将 1nM 的标准品溶液和 0.1nM 的工作液存放在–20
℃是非常重要的,如能置于–70℃中,则保存时间会更长。无 RNA 酶环境:须事先注意的是:避免储存液被 RNA 酶 污染。
a.     所有的操作都推荐使用无 RNA  酶并高压灭菌过的移 液器及吸头。
b.     操作试剂时请戴上手套。

miRNA 逆转录引物的操作

试剂盒中提供的逆转录引物是 10μM 的工作溶液,请根据每次
的实际用量将其稀释成 1μM 的 miRNA 逆转录引物溶液贮存于–20
℃。在一次标准的 miRNA 逆转录中,逆转录引物的终浓度为 60nM。
 
逆转录反应体系的制备

Hairpin-itTM miRNAs 定量分析所用的模板可以是总 RNA,细胞裂解产 物或是纯化后的微小 RNA。投入反应的 RNA 模板量可以根据实验的需要 从1μg 到3μg 或者更多。除了在 42℃反应比较稳定之外,对于逆转录 反应及逆转录酶并没有特殊的要求,我们推荐您用 20μl 逆转录体系。更多 的信息可以参阅你所使用的逆转录试剂的操作说明。
 
以下表格提供了一次 20μl 标准逆转录反应的体系(以Promega逆转录产品为例,货号:M1701)


Component
Final Con.
Vol/1 rxns
5×RT buffer
4.00 μl
dNTP(10 mM)
0.375 mM
0.75 μl
U6 snRNA/ miRNA RT primers(1 μM)1
60 nM
1.20 μl
MMLV Reverse Transcriptase(200 U/μl)
40 U
0.20 μl
RNA Sample 2
1-3 μg
X μl
RNase Free H2O

To 20 μl 3

1 可单独或混合逆转录miRNAs和U6;
2 RNA 模板量可以根据实验的需要从1 μg到3 μg或者更多。
3 除了在42℃反应比较稳定之外,对于逆转录反应及逆转录酶并没有特殊的要求,我们推荐您
  用20μl 逆转录体系。


miRNA 逆转录程序

标准的逆转录反应程序:
26℃ 40 分钟,42℃ 40 分钟,85℃ 10 分钟,4℃保存。
(如客户自行提供逆转录试剂,反应条件须参考试剂供货说明书)
 
 
请把所有的试剂,反应的混合液和样品至于冰上。配置完成后,请将反应的混合液置于以 cDNA 合成的温度进行预热后的热循环仪上,立即开始逆转录反应。逆转录反应 85℃ 5 分钟结束后立即将 cDNA 产物取出, 快速置冰上冷却,后续所有步骤都在冰上进行,不要将 cDNA 产物随便从冰上移走。
miRNAs 实时定量 PCR 的操作程序
 

miRNA 逆转录产物的操作         

混匀cDNA并且从中吸取2 μl(20 μl体系)当作定量PCR的模板。如果逆
转录引物工作液是U6 snRNA和miRNA的引物混合物,cDNA产物可作为U6
snRNA和miRNA荧光定量PCR反应的共同模板。逆转录cDNA暂时不用,可将
其存放于-20℃,三天内可保持稳定,长期保存请冻存于-80℃。
 
a. 按照下表分别配置miRNA和U6 snRNA 两个独立的荧光定量反应体系;

b. 建议客户在使用前混匀并低速离心,确保2× Real-time PCR Master Mix、50× ROX
Reference Dye、引物、模板完全溶解,所有的试剂都在管底或板孔底部。
c. 建议置于冰上进行Real Time PCR反应液的配制:

Component Final Con. Vol /1 rxns
2× Real-time PCR Master Mix(SYBR)
10μl
miRNA/U6 snRNA specific Primer set(10μM)
0.2μM  0.4μM
cDNA
  2μl
rTaq DNA polymerase(5 U/μl)
1U     0.2μl
RNase free H2O
  To 20μl




miRNAs 实时定量 PCR 反应程序
请您在您的定量PCR仪上设定如下程序:

95℃ for 3 minutes’ hold, 

40 cycles of:

95℃, 12 seconds
62℃, 40 seconds
采集荧光信号应设在 62℃这一步。
 
建立一条标准曲线


试剂盒所提供的miRNAs标准品可以被添加到您从组织或是细胞中提取的
总RNA中当作miRNA对照。如果要知道一定量的RNA样品中miRNA具体的拷 贝数,我们推荐您可以按照以下步骤建立一条标准曲线。

1.   向RNA标准品中加入1ml的RNA dilution buffer到1nM的贮存浓度,准备另一个1.5mlEP管,把1nM的miRNA标准溶液稀释成0.1nM的工作浓度。把1nM miRNA标准储存液与引物和Master Mix分开存放于-70℃。
2.   将0.1nM的miRNA标准品用不含RNA酶的水稀释5~7个数量级。
3.   向20μl的逆转录体系中分别加入上述一系列稀释的RNA样品2μl。注意在逆 转录反应中每个浓度梯度应设置2~3个复孔。
4.   取4μl逆转录产物至40μl的定量PCR体系中。注意在PCR时每个浓度梯度也 应设置2~3个复孔。
5.   该标准曲线中,2μl 0.1nM  的RNA标准品加入至20μl逆转录体系中约代表 每个反应中包含6 ×107个拷贝。

1.如果是做多重反应,把所需的共同组分配成mix分装于管中或板孔中,再单
独加反应所需的不同组分,所有操作务必在冰上进行。在做PCR反应时必须 严格的配制Mix来减少移液的误差。
2. 确保所有的试剂都在管底或板孔底部,必要的话可以短暂的离心。
 
质量控制

本产品用Hela细胞总RNA作为模板,用qRT-PCR进行了严格的测试,动态分析必
须表明在1pg的Hela细胞总RNA中,减少靶标的浓度和GAPDH和mRNA的量具有线 性的剂量效应。

产品说明书

相关文献

Cui, W., Q. Li, et al. "MiR-126-3p regulates progesterone receptors and involves development and lactation of mouse mammary gland." Molecular and Cellular Biochemistry 355(1): 17-25.

Zhang, C., J. Zhang, et al. "High level of miR-221/222 confers increased cell invasion and poor prognosis in glioma." Journal of Translational Medicine 10(1): 119.

Li, H. M., C. M. Wang, et al. "MiR-15a Decreases Bovine Mammary Epithelial Cell Viability and Lactation and Regulates Growth Hormone Receptor Expression." Molecules 17(10): 12037-12048.

Chen, L., L. Han, et al. "VHL regulates the effects of miR-23b on glioma survival and invasion via suppression of HIF-1/VEGF and -catenin/Tcf-4 signaling." Neuro-Oncology 14(8): 1026-1036.

订购须知

目录分类 本商品目录中的产品介绍按以下内容分类:

1. RNA干扰研究工具
2. miRNA研究工具 

产品价格 本产品目录中标示的价格均为国内统一零售参考价,全部为人民币价格。如果大量定购时,在标准价格的基础上有不同程度的优惠。 

质量保证 凡吉玛公司的产品均有严格的质量保证。如果我们发现确实存在质量问题时,保证更换产品。如果在到货后一个月之内用户无提出异议,我们将视本产品为优良产品而不再受理投诉事宜。提出产品异议(或投诉)时,切莫在产品使用完(或快使用完)后提出,以备本公司回收产品,确认产品质量。由于订错产品而产生的退货情况,原则上由客户承担相关费用。发生投诉事宜时,公司只保证在产品价格额度范围之内酌情赔偿,恕不受理超过制品价格额度以上之部分。退款时需退还原始发票。

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